Las Enfermedades Autoinmunes Sistémicas (EAS) son patologías autoinmunes no órgano específicas y se caracterizan por la pérdida de la autotolerancia, que en la clínica se observa como la afección de múltiples órganos o tejidos de forma simultánea. Los pacientes que presentan estas afecciones como Artritis Reumatoide, Lupus Eritematoso y Espondiloartritis, presentan una mayor predisposición a las manifestaciones sintomáticas de parasitosis intestinales, ya sea por su propia enfermedad de base como por el tratamiento que reciben para la misma (inmunomoduladores, inmunosupresores o medicamentos biológicos). Objetivos: Estudiar la prevalencia de parásitos intestinales en pacientes asistidos en la Unidad de Enfermedades Autoinmunes Sistémicas de la Clínica Médica “C” del Hospital de Clínicas “Dr. Manuel Quintela” entre marzo y noviembre de 2019. Metodología: A los pacientes con LES y Esclerodermia atendidos en la Unidad de Enfermedades Autoinmunes Sistémicas que acordaron integrar este estudio, se les entregaron frascos para la recolección de tres muestras de materia fecal de diferentes días. Se buscaron parásitos intestinales a través de Exámenes Coproparasitarios Seriados y técnicas específicas para diagnóstico de gérmenes oportunistas. Resultados: Participaron del estudio un total de 50 pacientes que cumplían los criterios de inclusión. Se procesaron un total de 133 muestras de materias fecales, de las cuales 3 fueron positivas para Endolimax nana pertenecientes al mismo paciente. Discusión: La prevalencia de enteroparasitosis observada en este proyecto resultó notoriamente por debajo de lo esperado. Se analizan distintos factores que pudieran contribuir a este resultado, se supone un escenario de pacientes con acceso a agua potable o que practican medidas preventivas para prevenir estas parasitosis. A su vez, se plantea la posibilidad que la medicación utilizada en estas patologías pudiera tener algún efecto terapéutico sobre las enteroparasitosis, esto último deberá ser estudiado más a fondo por este equipo analizando mecanismos de acción de inmunosupresores y demás fármacos empleados y sus posibles efectos antiparasitarios.